對于使用后的效果，兩者之間也是不同的
芽孢作用于有機質(zhì)積累多的池塘迅速轉(zhuǎn)化有機物為無機養(yǎng)分，（大部分的異養(yǎng)菌代謝過程都是這樣），這時水體無機養(yǎng)分迅速升高，透明度會有所變高，此時如果水體藻類基礎良好，天氣也正常，那么水會迅速變肥，其實先不要定論是否變肥，只能說藻類大量生長，水質(zhì)變濃，如果是有益于魚類增值的藻類可以說是變肥，反之，則只能說變濃。如果此時水體藻類基礎差，或是下菌后又恰好遇到陰雨天，那么此時，必然會氨氮亞鹽升高，如果不開增氧，水質(zhì)會更加不適應魚類生長，所以也是為什么有的養(yǎng)殖戶用了芽孢發(fā)生死魚。即是偶然也是必然。
光合用于水體以后，如果是養(yǎng)殖前期，池塘的積累不多或是上年的積累物質(zhì)水溫沒有起來，沒有被釋放，這個時候用光合以后特別是大量用以后，和藻類爭奪營養(yǎng)，藻類會很快被抑制，迅速把水變清，這點絕對不是我們養(yǎng)殖戶所喜歡的結(jié)果，所以說，前期用光合，可以少量，或是和結(jié)合無機肥－起使用，和無機肥配合使用是比較好的途徑，可以把簡單的廉價的肥料轉(zhuǎn)化為營養(yǎng)豐富的浮游生物，對雜食性特別是濾食性魚類。單獨的無機肥往往只是把水變濃，而不是真正的變肥。那么，養(yǎng)殖中后期，特別是精養(yǎng)池塘，池塘每日投入變多，加上池塘底部大量的積累物質(zhì)在溫度起來以后迅速被異養(yǎng)菌分解釋放為無機養(yǎng)分，這個過程就和芽孢分解轉(zhuǎn)化過程是一樣的了，這個時候用光合，量就可以適當加大，至于還需不需要配合無機肥，就要看實際情況，靈活掌握了。
最后，本著一個從事養(yǎng)殖－線的我，告訴大家，不要想今天用這個菌，明天又用那個菌，就普通調(diào)水來說，堅持用好芽孢或是光合就夠了，你看哪個省錢就用哪個，普通養(yǎng)殖一定要控制成本，減少折騰。好多的養(yǎng)殖戶就是喜歡瞎折騰。累了人不說更賺不到錢。
